Kollaborative Entwicklung eines computational-tool für Corona-Virus-Forschung

Es gibt derzeit mehr als 10.000 wissenschaftliche Artikel im Zusammenhang mit coronavirus-Infektionen. In der Tat, in den letzten Wochen, die Forschung zur Bekämpfung COVID-19 hat sich beschleunigt, und mehr als 4.000 neue wissenschaftliche arbeiten veröffentlicht worden, die auf potenzielle Impfstoffe, Therapien und Behandlungen. Die Verarbeitung dieser Mengen an Informationen manuell wäre unhandlich, um in der Lage sein, um vorab ist daher dringend erforderlich, die Forschung schnell genug. IRB Barcelona “ Strukturelle Bioinformatik und Netzwerk-Biologie-Labor, geleitet von ICREA-Forscher Patrick Legierung, hat gemeinsam mit Amazon zu entwickeln, die ein Computer-tool, würde das den Prozess beschleunigen. Die Verwendung von künstlicher Intelligenz, dieses tool „Lesen“ alle diese Artikel, und extrahieren Sie alle relevanten Informationen in Bezug auf die Moleküle und Behandlungen untersucht.

Durch eine prüferische Durchsicht der meisten relevanten wissenschaftlichen Literatur, Forscher an IRB Barcelona haben bisher identifiziert mehr als 150 verbindungen—mit verschiedenen Ebenen der experimentelle Nachweis—, die potenziell aktiv gegen COVID-19. Das Ziel ist nun auf der Suche nach anderen Arzneimitteln mit Eigenschaften ähnlich wie diese, damit erweitert sich das portfolio der Moleküle und die Erhöhung der Möglichkeiten der Identifizierung mit hoher Effektivität. Die Ergebnisse sind bereits verfügbar sbnb.irbbarcelona.org/covid19/ .

„Was wir jetzt brauchen, ist für die Forschung Arbeitsgruppen, die sich mit COVID-19-Behandlungen stellen Ihre Ergebnisse“, erklärt Legierung. „Die neuen Moleküle eingebaut wird, automatisch einmal am Tag, und damit der gesamten wissenschaftlichen Gemeinschaft aktualisierten Daten, die helfen, Doppelarbeit zu vermeiden und generieren neue Hypothesen, die helfen würde, zu finden, die endgültige Behandlung.“

Speedy Zusammenarbeit für drug discovery

Der Chemie Checker ist ein Computer-tool, die bietet Informationen, die auf 1 million Moleküle mit pharmakologischen Potenzial. „Der Chemie-Checker Ziele zu verarbeiten und zu Kodieren komplexe Daten über die Auswirkungen verschiedener chemischer Substanzen auf lebende Organismen, so dass Sie Aufnahme in die neue künstliche Intelligenz-Technologien“, sagt Miquel Duran, Forscher an IRB Barcelona-Gruppe und Erstautor der Studie.

In gut einer Woche, Hochwertige Labor-und Amazon etabliert haben, eine Zusammenarbeit, die sich aktiviert hat, um die Feinabstimmung dieser Bioinformatik-tool. „Es war eine Freude für uns, um uns unsere künstliche-Intelligenz-Fähigkeit in den Dienst der Erforschung von Medikamenten gegen COVID-19,“ sagt Hugo Zaragoza, von den Amazon-Suche von Wissenschaft und AI-Gruppe. Die Erfahrung, die Amazon hat mit text-mining, machine learning und natural language understanding), erlaubt die automatische Analyse von wissenschaftlichen Artikeln eingebunden werden, in der Chemie-Checker in einem schnellen Tempo. „Die Zusammenarbeit mit Amazon war der Schlüssel zu Holen Sie das tool und läuft so schnell. Ohne seine AWS-cloud-computing-und text-Bearbeitung Fähigkeiten, wäre es unmöglich gewesen“, sagt Legierung.

IRB Barcelona bekennt sich zu Forschung in COVID-19

Die Strukturelle Bioinformatik und Netzwerk-Biologie-Labor ist auch die Teilnahme an dem europäischen Projekt RiPCoN, gewidmet, um die Identifikation des menschlichen Proteinen, die das virus nutzt für seine expansion. Dieses Projekt versucht zu ermitteln, Drogen (bereits auf dem Markt bzw. in klinischen Studien), können Sie modulieren die Aktivität des virus, und halt seine Replikation.