Team entriegelt neue Art und Weise zu verstehen, sich entwickelnden Stämme von SARS-CoV-2

Forscher von CSIRO, Australia ‚ s national science Agentur, haben enthüllt einen neuen Ansatz der Analyse des genetischen codes oder der Blaupause—der SARS-CoV-2-virus verursacht, dass COVID-19.

Die Ergebnisse werden helfen, die Forscher besser verstehen, wie die Stämme des virus zu entwickeln und Identifizierung neuer Cluster des virus.

Die Analyse der globalen Daten auf den veröffentlichten genomsequenzen von dem neuartigen coronavirus, wird helfen fast-track-unser Verständnis dieser komplexen Krankheit.

Die Forscher entwickelten ein neuartiges Visualisierungs-Plattform, unterstützt durch die Bioinformatik-algorithmen, die ursprünglich zur analyse des menschlichen Genoms zu lokalisieren Unterschiede unter den tausenden von genetischen Sequenzen des SARS-CoV-2-virus.

CSIRO-Hauptgeschäftsführer Dr. Larry Marshall sagte, zu wissen, der genetische code von entscheidender Bedeutung war.

„Je mehr wir wissen über das virus, die besser bewaffnet werden wir es zu kämpfen,“ Dr. sagte Marshall.

„Diese höchst komplexe Analyse des Genoms des SARS-CoV-2-virus hat bereits dazu beigetragen, um zu bestimmen, welche Stämme des virus sind geeignet für die Prüfung von Impfstoffen im Gange, bei der australischen Zentrum für die Prävention und Vorsorge in Geelong—die nur hohe biocontainment Anlage Ihrer Art in der Südlichen Hemisphäre.“

CSIRO ist Bioinformatik Teamleiter Dr. Denis Bauer sagte, dass das virus sich weiter entwickelt, diese Blaupause wird immer wichtiger, effektiv, weil es enthält Anweisungen über das Verhalten des virus und welche Art von Krankheit verursachen kann.

„Weltweit gibt es jetzt eine riesige Menge von einzelnen virus-Sequenzen,“ sagte Dr. Bauer, der auch Dozent an der Macquarie University, Australien.

„Die Bewertung der evolutionären Distanz zwischen diesen Datenpunkten und zu visualisieren, hilft es, Forscher finden heraus, über die verschiedenen Stämme des virus—und auch, wo Sie herkamen und wie Sie sich weiter entwickeln.“

CSIRO ist Gefährlicher Krankheitserreger Team-Leiter Professor S. S. Vasan, wer der führende ist der SARS-CoV-2-virus arbeiten und die Impfstoff-Studien zur Evaluierung und den entsprechenden Autor des Papiers, sagte, dass die ersten 181 veröffentlichten Genom-Sequenzen aus der aktuellen COVID-19-Ausbruch wurden analysiert, um zu verstehen, wie Veränderungen in der virus könnte Auswirkungen auf sein Verhalten und seine Auswirkungen.

„Das RNA-virus wird erwartet, dass sich in eine Reihe von verschiedenen Clustern, die gemeinsam Mutationen, die ist, was wir haben, bestätigt und visualisiert werden“, sagte Professor Vasan, wer hält ein honorary chair an der University of York, UK.

„In dieser Zeit, die wir nicht erwarten, es wird sich auf die Entwicklung und Bewertung von COVID-19 Impfstoffe, Therapien und Diagnostika, aber es ist wichtig, Informationen zu überwachen, wie präklinische und klinische Studien Fortschritt.

„Um dies zu ermöglichen, fordern wir die internationale Forschungs-community zu teilen de-identifizierte Angaben der Fall, Schweregrad-und outcome -, und anderen relevanten meta-Daten wie Begleiterkrankungen und raucherstatus, neben den genomischen Sequenzen des virus.“

CSIRO, Australian e-Health Research Centre CEO David Hansen sagte, die Arbeit zeigt die Bedeutung der cross-Zusammenarbeit zwischen den etablierten und den aufstrebenden Disziplinen wie der Bioinformatik, Genomik, vaccinology und Virologie.

„Nach dem wissenschaftlichen Verfahren der peer-review-open-Publikation wie diese ist eine äußerst wichtige Komponente der CSIRO Antwort.“ Dr. Hansen sagte.

„Der Vorteil der Visualisierung von Daten-Plattform ist, dass es highlights sich entwickelnde genetische Mutationen des virus, wie es weiter zu ändern und an neue Umgebungen anzupassen“, sagte Dr. Bauer, der der erste Autor dieses Papiers.