Eine neue Krebs diagnostiziert wird alle 30 Sekunden in den Vereinigten Staaten. Alle drei Minuten, zwei Menschen in den USA sterben an Krebs. Einige der Todesfälle im Zusammenhang mit der Krankheit ergeben sich aus der Tatsache, dass das gleiche Medikament, das hilft, eine person kann sich nachteilig auf einem anderen mit der gleichen Art von Krebs.
„Dies ist eine der starken Fällen für personifizierte Medizin,“ sagte Nadia Atallah Lanman, ein Forschungs-Assistent professor in Purdue University College of Veterinary Medicine, die verwaltet die Purdue University Collaborative Kern für Krebs-Bioinformatik – (C3B). „Wir werden die Ausbildung der nächsten generation von Wissenschaftlern in der Lage sein zu verschieben die onkologische Forschung voran in einem datengesteuerten Art und Weise.“
Die C –3– B ist eine gemeinsame Bioinformatik-core-Regie: Jun Wan, assistant professor an der Indiana University, zwischen der Purdue University Center for Cancer Research (PCCR) und der Indiana University Melvin und Bren Simon Cancer Center (IUSCC). Diese beiden Krebs-Zentren bezeichnet werden, die von der National Cancer Institute als top-tier-Krebs-Forschungs-Organisationen, mit IUSCC vor kurzem Verwirklichung der umfassenden status.
Bioinformatik ist ein vielfältiges interdisziplinäres Feld, das verbindet Statistik, Biologie, informatik, Mathematik und Technik zu analysieren und zu interpretieren, komplexe biologische Daten-sets. Die Wissenschaftler versuchen zu verstehen, grundlegende und angewandte Forschung zu Fragen über die Entwicklung von Krebs und vorherzusagen, welche Menschen reagieren gut auf die Behandlungen.
C3B Wissenschaftler erforschen verschiedene biologische big data zum ausführen verschiedener Auswertungen, wie z.B. die Identifizierung von Mutationen im Genom oder gen-Expressionsmuster zugeordnet werden kann oder eine bestimmte Art von Krebs. Die C3B zusammen mit der Purdue Mitglieder der Fakultät Mike Childress, John Turek und David Nolte auf ein Projekt, das mit Haustier-Hunden mit natürlich auftretenden, diffusen großen B-Zell-Lymphom (DLBCL) als Modell für die Untersuchung der Chemotherapie-Resistenz in der Lymphom-Patienten.
DLBCL ist eine aggressive form von non-Hodgkin-Lymphom und die Hälfte der Patienten mit der Diagnose der Krankheit sterben werden, weil die Entwicklung der Chemotherapie-Resistenz. Das Projekt kombinierte gen-mutation Daten, die gen-expression-Daten und Daten von einer Technik, die biologisch-dynamische Bildgebung (BDI), entwickelt von Nolte und Turek, die durchgeführt phänotypischen Profilierung der drei-dimensionalen Gewebe Proben.
Genetische Mutationen, BDI Daten und Genexpression Signaturen, die im Zusammenhang mit der Entwicklung der Chemotherapie-Resistenz und schlechte Behandlungsergebnis identifiziert wurden. Diese Studie könnte die Weise ändern, die ärzte verschreiben, Behandlungen für DLBCL, sowie Identifizierung von Molekülen und Prozessen, die ausgerichtet werden können durch neue Chemotherapeutika, die dabei helfen könnten, Patienten, die Widerstand zu einer standard-Chemotherapie-Regime.
„Die Tatsache, dass die beiden Universitäten arbeiten zusammen, um weiterhin den Aufbau und den Betrieb der C3B ist wirklich eine Stärke,“ Lanman sagte. „Diese komplexen Probleme sind nicht alle gelöst werden, indem ein Forscher. Wir müssen zusammenarbeiten, um die Entwicklung personalisierter Therapien, und wirklich zu Herzen, was Krebs verursacht und was kann getan werden, um zu verhindern, dass Krebs.“
Wan sagte, „Unser Kern hat eine einzigartige Bioinformatik team, das verteilt sich über die beiden campus und hat einen großen Einfluss bereits auf die Forschung an beiden Institutionen. Die C3B hat erfolgreich unterstützt 107 Mitglieder von zwei Krebs-Zentren auf 306 verschiedenen Projekte während der vergangenen drei bis vier Jahren.“
Tim Ratliff, Robert Wallace Miller Direktor der Purdue University Center für die Krebsforschung gearbeitet hat, ist mit C3B Bioinformatiker aus beiden IUSCC und PCCR in seiner Forschung, mit dem Schwerpunkt auf das Verständnis der Immunregulation und der Entwicklung neuartiger Ansätze für die Behandlung von urologischen Krebserkrankungen wie Blasenkrebs und Prostatakrebs durch die modulation der anti-Krebs-Immunität.